RpaB контролира сложен регулон, далеч извън фотосинтетичните машини

Експресията на РНК регулаторите IsrR, PsrR1 и други зависи от RpaB

RpaB показва кръстосани разпоредби с други транскрипционни фактори, NtcA и Fur

RpaB е решаващ транскрипционен регулатор във фотосинтетичния микроорганизъм

Обобщение

Кислородната фотосинтеза изисква координация на стимулите на околната среда с регулирането на транскрипцията. Транскрипционният фактор RpaB се запазва от най-простите едноклетъчни цианобактерии до сложни еукариотни водорасли, представляващи повече от 1 милиард години еволюция. За да се предскаже контролираният от RpaB регулон в цианобактерията Synechocystis, ние анализирахме позиционното разпределение на свързващите места заедно с данните за картографиране с висока разделителна способност на стартовите места за транскрипция (TSS). Ние описваме повече от 150 целеви промоутъра, чиято активност отговаря на променливите условия на светлина. Сайтове за обвързване в близост до TSS медиират репресия, докато сайтовете центрират ∼50 nt нагоре по веригата активиране на медиацията. Използвайки допълнителни експериментални подходи, открихме, че RpaB контролира гени, участващи в фотозащита, цикличен електронен поток и преходи на състояния, фотодишане и nirA и isiA, за които предлагаме кръстосана регулация с транскрипционните фактори NtcA или FurA. Дълбоката интеграция на RpaB с разнообразни фотосинтетични генни функции го прави един от най-важните и универсални транскрипционни регулатори.

Графичен резюме

биокомпютърни
  1. Изтегляне: Изтегляне на изображение с висока разделителна способност (321KB)
  2. Изтегляне: Изтеглете изображение в пълен размер

Предишен статия в бр Следващия статия в бр