Годишен преглед на биохимията

преглед

Кн. 86: 245-275 (Дата на публикуване на том, юни 2017 г.)
За първи път публикувано като авансово ревю на 8 март 2017 г.
https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-061516-044757

Йенс Нилсен 1,2,3

1 Катедра по биология и биологично инженерство, Технологичен университет Чалмърс, SE41128 Гьотеборг, Швеция; имейл: [имейл защитен]

2 Център за биоустойчивост на Фондация Novo Nordisk, Технически университет в Дания, DK2800 Lyngby, Дания

3 Лаборатория Science for Life, Кралски технологичен институт, SE17121 Стокхолм, Швеция

Резюме

Метаболизмът е изключително сложен и включва хиляди различни свързани реакции; следователно е необходимо да се използват математически модели за холистични изследвания. Използването на математически модели в биологията се нарича системна биология. В този преглед са описани принципите на системната биология и са обсъдени два различни типа математически модели, използвани за изучаване на метаболизма: кинетични модели и метаболитни модели в мащаб на генома. Представено е използването на различни омически технологии, включително транскриптомика, протеомика, метаболомика и флуксомика, за изучаване на метаболизма. И накрая, обсъжда се приложението на системната биология за анализ на глобални регулаторни структури, инженеринг на метаболизма на клетъчните фабрики и анализ на човешките заболявания.