Резултат от анотация: 2 от 5

глюкагон-1

Резултатът от анотацията осигурява евристична мярка на съдържанието на анотацията на запис на UniProtKB или протеома. Този резултат не мога да се използва като мярка за точността на анотацията, тъй като не можем да дефинираме „правилната анотация“ за даден протеин.

- Експериментални доказателства на ниво протеин i

Това показва вида на доказателствата, които подкрепят съществуването на протеина. Имайте предвид, че доказателствата за „наличие на протеин“ не дават информация за точността или правилността на показаната последователност (и).

Изберете раздел отляво, за да видите съдържанието.

Този раздел предоставя всякаква полезна информация за протеина, най-вече биологични познания.

Проектът за генна онтология (GO) предоставя набор от йерархично контролиран речник, разделен на 3 категории:

GO - Молекулярна функция i

Ключовите думи на UniProtKB представляват контролиран речник с йерархична структура. Ключовите думи обобщават съдържанието на запис в UniProtKB и улесняват търсенето на протеини, които представляват интерес.

Този раздел предоставя информация за протеиновите и генните имена и синоними и за организма, който е източникът на протеиновата последователност.

Имена и таксономия i

Този подраздел на раздела Имена и таксономия предоставя изчерпателен списък на всички имена на протеина, от често използвани до остарели, за да позволи еднозначно идентифициране на протеин.

Ръчно подбрана информация, която се основава на твърдения в научни статии, за които няма експериментална подкрепа.

Ръчно твърдение въз основа на мнение в i

Този подраздел на раздела Имена и таксономия предоставя информация за името (ите) на организма, което е източникът на протеиновата последователност.

Този подраздел на раздела Имена и таксономия показва уникалния идентификатор, присвоен от NCBI на организма източник на протеина. Това е известно като „таксономичен идентификатор“ или „таксиметров“.

Този подраздел на раздела Имена и таксономия съдържа таксономичната йерархична класификация на изходния организъм. Той изброява възлите, както се показват отгоре надолу в таксономичното дърво, като първо е изброено по-общото групиране.

Този раздел предоставя информация за местоположението и топологията на зрелия протеин в клетката.

Подклетъчно местоположение i

Извънклетъчна област или секретирана

Автоматично изчислително твърдение

Графика на Christian Stolte & Seán O’Donoghue; Източник:

Извънклетъчна област или секретирана
Извънклетъчна област или секретирана

Ключови думи - клетъчен компонент i

Този раздел описва посттранслационни модификации (PTM) и/или обработка на събития.

PTM/обработка i

Обработка на молекули

Този подраздел на раздела „PTM/обработка“ описва позицията и дължината на активен пептид в зрелия протеин.

Ръчно подбрана информация, за която има публикувани експериментални доказателства.

Ръчно твърдение въз основа на експеримент в i

Този раздел предоставя информация за експресията на ген на ниво иРНК или протеин в клетки или в тъкани на многоклетъчни организми.

Този подраздел на раздела „Експресия“ отчита експериментално доказаните ефекти на индукторите и репресорите (обикновено химични съединения или фактори на околната среда) върху нивото на експресия на протеини (или иРНК) (регулиране нагоре, регулиране надолу, конститутивна експресия).

Този раздел предоставя информация за кватернерната структура на протеин и за взаимодействието (ата) с други протеини или протеинови комплекси.

GO - Молекулярна функция i

Този раздел предоставя информация за третичната и вторичната структура на протеин.

Бази данни с 3D структура

SWISS-MODEL Repository - база данни с коментирани 3D модели на протеинова структура

База данни за сравнителни модели на протеинова структура

Този раздел предоставя информация за сходството на последователността с други протеини и домена (ите), присъстващ (и) в протеин.

Семейство и домейни i

Този подраздел на раздела "Семейство и домейни" предоставя информация за сходството на последователността с други протеини.

Прилики на последователността i

Бази данни за семейство и домейн

Интегриран ресурс от протеинови семейства, домейни и функционални сайтове

База данни на домейн за протеини на Pfam

База данни за пръстови отпечатъци на протеинов мотив; база данни за протеинов домейн

Прост модулен инструмент за изследване на архитектурата; база данни за протеинов домейн

PROSITE; база данни за протеинов домейн и семейство

Този раздел показва по подразбиране каноничната протеинова последователност и при поискване всички изоформи, описани в записа. Той също така включва информация, отнасяща се до последователността (ите), включително дължина и молекулно тегло. Информацията се съхранява в различни подраздели. Настоящите подраздели и тяхното съдържание са изброени по-долу:

Този подраздел на секцията Последователност показва дали каноничната последователност, показана по подразбиране в записа, е пълна или не.

Състояние на последователността i: завършено.

Контролната сума е форма на проверка на резервиране, която се изчислява от последователността. Полезно е за проследяване на актуализации на последователността.

Трябва да се отбележи, че докато на теория две различни последователности могат да имат една и съща стойност на контролната сума, вероятността това да се случи е изключително ниска.

UniProtKB обаче може да съдържа записи с идентични последователности в случай на множество гени (паралози).

Контролната сума се изчислява като последователност 64-битова стойност за проверка на циклична излишък (CRC64), като се използва полином на генератора: x 64 + x 4 + x 3 + x + 1. Алгоритъмът е описан в стандарта ISO 3309.

Press W.H., Flannery B.P., Teukolsky S.A. и Vetterling W.T.
Циклично съкращаване и други контролни суми
Числени рецепти в C 2-ро издание, pp896-902, Cambridge University Press (1993))

Контролна сума: i 68D3FFC57AA664EF

Този раздел предоставя връзки към протеини, които са подобни на протеиновите последователности, описани в тази публикация на различни нива на прагове за идентичност на последователността (100%, 90% и 50%) въз основа на тяхното членство в UniProt Reference Clusters (UniRef).

Подобни протеини i

Този раздел се използва за насочване към информация, свързана със записи и намерена в колекции от данни, различни от UniProtKB.

Бази данни с 3D структура

Бази данни за семейство и домейн

ProtoNet; Автоматична йерархична класификация на протеините

MobiDB: база данни за белтъчни разстройства и анотации на мобилността

Този раздел предоставя обща информация за записа.

Информация за влизане i

Този подраздел на раздела „Информация за въвеждане“ предоставя мнемоничен идентификатор за запис на UniProtKB, но не е стабилен идентификатор. На всеки прегледан запис се присвоява уникално име на запис при интегриране в UniProtKB/Swiss-Prot.

Този подраздел на раздела „Информация за влизане“ предоставя един или повече номера за присъединяване. Това са стабилни идентификатори и трябва да се използват за цитиране на записи на UniProtKB. При интегриране в UniProtKB на всеки запис се присвоява уникален номер за присъединяване, който се нарича „Основен (приложим) номер за присъединяване“.

Този подраздел на раздела „Информация за запис“ показва датата на интегриране на записа в UniProtKB, датата на последната актуализация на последователността и датата на последната модификация на анотацията („Последна промяна“). Показва се също номерът на версията както на записа, така и на каноничната последователност.

Този подраздел на раздела „Информация за влизане“ показва дали записът е бил ръчно анотиран и прегледан от кураторите на UniProtKB или не, с други думи, ако записът принадлежи към раздела Swiss-Prot на UniProtKB (прегледани) или към компютърно анотираната секция TrEMBL (непрегледано).

Този раздел съдържа всякаква подходяща информация, която не се побира в други дефинирани раздели