Принадлежности

  • 1 WALTHAM Център за хранене на домашни любимци, Waltham-on-the-Wolds, Leicestershire, Великобритания.
  • 2 Катедра по животновъдни науки, Университет на Илинойс, Урбана, Илинойс, Съединени американски щати; Отдел по хранителни науки, Университет на Илинойс, Урбана, Илинойс, Съединени американски щати; Катедра по ветеринарна клинична медицина, Университет на Илинойс, Урбана, Илинойс, Съединени американски щати.
  • PMID: 25010839
  • PMCID: PMC4091873
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0101021
Безплатна статия от PMC

Автори

Принадлежности

  • 1 WALTHAM Център за хранене на домашни любимци, Waltham-on-the-Wolds, Leicestershire, Великобритания.
  • 2 Катедра по животновъдни науки, Университет на Илинойс, Урбана, Илинойс, Съединени американски щати; Отдел по хранителни науки, Университет на Илинойс, Урбана, Илинойс, Съединени американски щати; Катедра по ветеринарна клинична медицина, Университет на Илинойс, Урбана, Илинойс, Съединени американски щати.

Резюме

Заден план: По-рано демонстрирахме, че съотношението протеин: въглехидрати драстично влияе върху фекалната микробна таксономична структура на котенца, използвайки целево секвениране на 16S гени. Настоящото проучване, използвайки същите фекални проби, приложи дълбоко секвениране на пушка Illumina, за да идентифицира свързания с диетата функционален потенциал и да анализира таксономичните промени на котешкия фекален микробиом.

deep

Методология и основни констатации: Фекални проби от котенца, хранени с една от двете диети, различаващи се по съдържание на протеини и въглехидрати (високо протеиново, нисковъглехидратно, HPLC; и умерено белтъчно, умерено въглехидратно, MPMC) бяха събрани на 8, 12 и 16 седмична възраст (n = 6 на група). От 36 проби са генерирани общо 345,3 гигабази последователности, като 99,75% от анотираните последователности са идентифицирани като бактериални. На ниво род 26% и 39% от четенията са отбелязани за котета, хранени с HPLC и MPMC, като котките, хранени с HPLC, показват по-голямо видово богатство и микробно разнообразие. Две фила, десет семейства и петнадесет рода са отговорни за над 80% от последователностите на всяко таксономично ниво и за двете диетични групи, в съответствие с предишното таксономично проучване. Значително различни количества в диетични групи са наблюдавани за 324 рода (56% от всички идентифицирани родове), показващи широко разпространени индуцирани от диетата промени в микробната таксономична структура. Разнообразието не е било засегнато във времето. Функционалният анализ установи, че 2013 предполагаеми ензимни функционални групи са различни (p Заключения: Тези данни показват, че получените от котки микробиоми имат големи структурни и функционални разлики, свързани с диетичното съотношение протеин: въглехидрати и подчертават въздействието на диетата в началото на живота.

Изявление за конфликт на интереси

Конкуриращи се интереси: Авторите имат следните интереси. Финансиране за това проучване беше осигурено от Mars Petcare. OD, CO, AC, PM, DA и PJ са наети от WALTHAM Center for Pet Nutrition, изследователски център за Mars Petcare. Няма патенти, продукти в разработка или предлагани на пазара продукти, които да бъдат декларирани. Това не променя тяхното придържане към всички политики PLOS ONE за споделяне на данни и материали, както е подробно описано онлайн в ръководството за автори.

Фигури

Фигура 1. Видово разнообразие и богатство на ...

Фигура 1. Видово разнообразие и богатство на котешки фекални микробиоми чрез диета.

а) Разнообразието на Шанън ...

Фигура 2. Таксономични профили за 20-те ...

Фигура 2. Таксономични профили за 20-те най-разпространени рода.

19-те най-разпространени рода ...

Фигура 3. Функционални профили за 280 биохимични ...

Фигура 3. Функционални профили за 280 биохимични пътища (ниво KEGG 3).