Годишен преглед на биохимията

нуклеази

Кн. 88: 191-220 (Дата на публикуване на том, юни 2019 г.)
За първи път публикувано като авансово преглед на 18 март 2019 г.
https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-013118-111730

Daesik Kim, 1, * Kevin Luk, 2, * Scot A. Wolfe, 2 и Jin-Soo Kim, 1,3

Резюме

Програмируеми нуклеази и дезаминази, които включват нуклеази с цинкови пръсти, подобни на транскрипция активаторни ефекторни нуклеази, CRISPR РНК-ориентирани нуклеази и РНК-ориентирани базови редактори, сега се използват широко за целенасочена модификация на геноми в клетките и организмите. Тези инструменти за редактиране на гени имат огромно обещание за терапевтични приложения. Важно е, че тези нуклеази и дезаминази могат да проявяват нецелева активност чрез разпознаване на почти сродни ДНК последователности на техните целеви места, което води до колатерално увреждане на генома под формата на локална мутагенеза или геномни пренареждания. За терапевтични приложения за редактиране на геном с тези класове програмируеми ензими е от съществено значение да се измери и ограничи нецелевата активност в целия геном. Тук обсъждаме ключовите детерминанти на нецелевата активност за тези системи. Ние описваме различни клетъчни и безклетъчни методи за идентифициране на геномни нецелеви сайтове и различни стратегии, които са разработени за намаляване на нецелевата активност на програмируеми генно-редактиращи ензими.

Ключови думи

  • маса 1 -Списък на изчислителните прогнозни алгоритми за gRNA анализ извън целта
  • Таблица 2 -Сравнение на няколко обективни метода в целия геном в един общ целеви сайт, VEGFA TS1

Фигура Местоположения