Субекти
Резюме
Обективен
Индексите на разпределение на телесните мазнини са наследствени, но са съобщени малко генетични сигнали от проучвания за асоцииране в целия геном (GWAS) на измервания на компютърна томография (КТ) за разпределение на телесните мазнини. Стремихме се да идентифицираме гени, свързани с признаците на затлъстяване и ключовите двигатели, които са от основно значение за регулаторните мрежи на мастната тъкан.
Субекти
Анализирахме данните за експресия на генни транскрипти в кръв от участници в Framingham Heart Study, голяма кохорта, базирана в общността (н до 4303), както и реализира интегративен анализ на тези данни и съществуваща биологична информация.
Резултати
Анализът на нашата асоциация идентифицира уникални и често срещани подписи на генната експресия в няколко признака на затлъстяване, включително индекс на телесна маса, съотношение на талията и ханша, обиколка на талията и показатели, измерени с CT, включително обем и качество на висцералните и подкожните мастни тъкани. Идентифицирахме шест обогатени KEGG пътища и два модула за съвместна експресия за по-нататъшно изследване на мастните регулаторни мрежи. Интегративният анализ разкрива четири генни набора (Apoptosis, p53 сигнален път, Proteasome, Ubiquitin-медиирана протеолиза) и два модула за ко-експресия със значими генетични варианти и 94 ключови драйвери/гени, чиито локални мрежи са обогатени с гени, свързани с адипозността, което предполага, че тези обогатени пътища или модули имат генетични ефекти върху затлъстяването. Повечето идентифицирани ключови гени-двигатели участват в основни биологични процеси като контрол на клетъчния цикъл, възстановяване на ДНК и разграждане на регулаторните протеини са свързани с рак.
Заключения
Нашият интегративен анализ на генетична, транскрипционна и биологична информация предоставя списък с убедителни кандидати за по-нататъшни последващи функционални проучвания за разкриване на биологичните механизми, залегнали в основата на затлъстяването. Тези кандидати подчертават стойността на изследването на извлечени от КТ и централни черти на затлъстяването.
- Човешкото затлъстяване, свързано с генетични варианти в рецепторния коактиватор
- Информационен център за генетични и редки болести за наследствена сфероцитоза (GARD) - програма NCATS
- Здравословното хранене преодолява генетичното предразположение към затлъстяване
- Информационен център за генетични и редки болести Hidradenitis suppurativa (GARD) - програма NCATS
- Идентифициране на генетични локуси, свързани с различни реакции на затлъстяване, предизвикано от диета с високо съдържание на мазнини