Щракнете върху тази

  • Профил
  • Образование
  • Изследвания
  • Източници за финансиране на научни изследвания
  • Членства
  • Избрани публикации
  • Достъп до колекция от култури
  • Членове на лабораторията
  • Студенти
  • Възпитаници
  • Новини Статии
  • Завършили студенти

Започнах изследователската си кариера с бакалавърска и магистърска степен в Централните ветеринарни лаборатории (сега Агенция за ветеринарни лаборатории) и Центъра за приложни и микробиологични изследвания (CAMR, сега Агенция за защита на здравето), Великобритания, под ръководството на проф. Мартин Удуърд. Там изучавах ентерогенния патоген Salmonella enterica serovar Enteritidis и развих солидна оценка на многото препятствия, които ентеричният патоген трябва да преодолее в червата, за да причини заболяване. Очаровах се от огромния арсенал от фактори на вирулентност, необходими на ентеричните патогени, за да оцелеят и да се размножават в чревната среда.

Прекарах кратък постдокторски период в CAMR, като се научих да работя с технически предизвикателни патогени като Mycobacterium tuberculosis и Campylobacter jejuni, преди да се преместя в Канада през 2001 г., за да започна постдокторска позиция в Университета на Калгари, под съвместното ръководство на д-р. Ребека ДеВини и Майк Сурет. Тук работих върху ентеропатогенни и ентерохеморагични Е. coli (EPEC и EHEC), използвайки техники за клетъчна и молекулярна биология, за да изследвам очарователните взаимодействия на техните системи за секреция от тип III с клетки гостоприемници.

Винаги съм се интересувал да науча повече за нормалната микробна популация в човешките черва и през 2004 г. имах щастието да спечеля награда за преход между колеги към факултет чрез Канадската асоциация по гастроентерология. Тази награда ми позволи да разработя независима изследователска програма, насочена към изследване на нормалната човешка микробиота и нейното влияние върху човешкото здраве и болести, програма, която донесох със себе си в Гвелф през декември 2007 г.

Откакто съм тук, благодарение на много талантливия си персонал и студенти изградих анаеробна микробиология от световна класа и я насочих както към отговори на фундаментални изследователски въпроси, така и към създаване на транслационни възможности за преместване на науката в клиниката. През 2013 г. съм съосновател на NuBiyota, компания, чиято мисия е да разработи „Микробна екосистемна терапия“ за лечение на разстройства, чиято основна причина е чревната микробна дисбиоза.

Моят девиз: „Моите микроби ми казаха да го направя“
Моите хобита: Градинарство, четене, четене за градинарство

  • Бакалавър (Отличие) Биохимия, Лондонски университет
  • Доцент доктор. Молекулярна биология, Отворен университет съвместно с CAMR, Великобритания
  • Следдокторант, Университет в Калгари

Изследванията в моята лаборатория са фокусирани върху изучаването на нормалната човешка чревна микробиота, както при заболявания, така и в здравето. Изследването може свободно да бъде разделено на няколко основни области, съсредоточени върху основни въпроси в областта на микробната екология на червата:

КАКВО РАСТЕ ТАМ?

Микробният свят в човешките черва, макар и не без присъщ фактор „ick“, е очарователно място, изпълнено с огромно разнообразие, но въпреки това много слабо разбрано. Докато молекулярните подписи показват, че микробиотичната общност в червата може да съдържа много стотици бактериални видове, само малък процент от тези видове се разбира от гледна точка на тяхната биология. Липсата на познания в тази област произтича от факта, че все още условията, необходими за култивиране на повечето бактериални видове, обитаващи човешките черва, не са добре разбрани. В моята лаборатория разработваме нови техники за култивиране и изследване на нови бактериални видове от червата, за да разберем по-добре как тези видове могат да допринесат за забележителната хомеостаза на микробиота общността като цяло. В центъра на нашия изследователски подход ние разработихме непрекъсната система за култивиране, за да моделираме бактериалните съобщества в дисталните черва, най-гъсто населената част от човешкото тяло по отношение на микробите. Наречен Robogut, нашият модел допринася за много от проектите в лабораторията. Щракнете върху тази връзка, за да видите скорошно парче с тази творба в радио предаването Quirks and Quarks на CBC. Щракнете върху тази връзка, за да видите как членовете на лабораторията ми обясняват системата подробно.

Радваме се на широко сътрудничество с Института Broad в Кеймбридж, Масачузетс, при което предоставихме значителен брой бактериални изолати, поискани за секвениране на генома чрез Human Microbiome Project. Продължаваме да работим в тясно сътрудничество с елементи от този проект, включително изготвянето на микробиологични стандарти за проекти за секвениране на HMP.

КАК ЧЕРВЕНАТА МИКРОБИОТА ОТГОВАРЯ НА СРЕДАТА СИ?

Ние се интересуваме от метаболитната продукция на чревната микробиота и как това се променя в отговор на стимулите от околната среда. Ние се интересуваме от отговора на чревната микробиота към лекарства, хранителни добавки и белтъци гостоприемници. Ние разработихме ЯМР като инструмент за метаболомика на пушка на микробни екосистеми, за да ни помогне да разберем метаболитните промени в отговор на смущения в микробиотата. В момента прилагаме този подход при изследването на няколко заболявания, включително диабет тип 1, колоректален рак и IBD.

Ние също се интересуваме от ролята на вирубиома - вирусния микробиом, за здравето на червата. Вирусите са най-многобройните компоненти на микробиома на човешките черва, но тяхната роля в развитието и динамиката на екосистемите не е добре разбрана. Системата Robogut ни предлага идеалната възможност да проучим взаимодействието на virome с клетъчните компоненти на чревната микробна екосистема.


КОИ БАКТЕРИАЛНИ ВИДОВЕ НА НОРМАЛНАТА МИКРОБИОТА МОГАТ ДА ДОПЪЛНЯВАТ ЗА ЗДРАВЕ/БОЛЕСТ?

При здрав човек, въпреки постоянно променящата се среда в червата, пребиваващата микробиота поддържа до голяма степен хомеостатичен баланс, който е уникален за гостоприемника. Става все по-ясно, че когато този баланс се измести, последиците за домакина могат да бъдат много вредни. Моята лаборатория изследва няколко ключови заболявания, свързани с чревната микробиота: колоректален рак, диабет тип 1 и инфекция с Clostridioides difficile (CDI).

Щракнете върху тази връзка, за да изтеглите статия от Medical Post, описваща тази работа.
Щракнете върху тази връзка, за да видите CTV The National парче, което описва използването на RePOOPulate за лечение на тежко болен пациент с CDI.

Колоректален рак е една от водещите форми на рак в света. През 2011 г., в сътрудничество с Агенцията за рак на BC, нашата лаборатория помогна да демонстрира изобилието на определен анаеробен вид, Fusobacterium nucleatum, при тумори на колоректалния рак. Това завладяващо откритие отвори вратата за много по-нататъшни проучвания, които в момента се провеждат, за да се опитат да характеризират ролята, която този загадъчен вид може да има при болестите. В моята лаборатория сме фокусирани върху разбирането как F. nucleatum взаимодейства с клетките гостоприемници, за да причини болести, и как този процес се влияе от фактори като диета на гостоприемника, съществуващ микробиом и употреба на антибиотици. В допълнение към това се надяваме, че терапевтичният екосистемен подход на NuBiyota може да бъде полезен за лечение на CRC чрез намаляване на натоварванията от F. nukleatum.

Диабет тип 1 (T1D) е сериозно метаболитно заболяване, при което тялото има затруднения в регулирането на нивата на кръвната захар, в резултат на панкреаса, произвеждащ недостатъчно количество инсулин. Има все повече доказателства, че чревната микробиота играе важна роля в развитието на T1D. По-специално, излагането на определени микробни видове, открити в червата, може да предизвика автоимунен отговор на клетките на панкреаса, произвеждащи инсулин, при чувствителни индивиди. Нашата лаборатория работи в сътрудничество с лабораторията на Jayne Danska, Sick Kids, за да се опита да разбере как и кои чревни микроби допринасят за диабета.

Какви са последствията от нашата „липсваща микробиота“?

Общоприето е, че хората в западния свят са колонизирани от по-малко разнообразна екосистема от тези на хората, които живеят без съвременни удобства, като племената на ловците-събирачи. Интересуваме се да разберем какво е различното в чревния микробиом на ловците-събирачи по отношение на метаболизма на „липсващите микроби“ чрез култивиране и изучаване на тези видове и използването им за допълване на западен микробиом.

Разбиране на микробиома на мишката