Наука за храните и храненето (бележка)

  • Пълен член
  • Цифри и данни
  • Препратки
  • Цитати
  • Метрика
  • Препечатки и разрешения
  • PDF

Резюме

Чревната микробиота на деца с алергия към храни беше анализирана чрез секвениране на 16S rRNA с висока производителност. При деца с хранителни алергии се наблюдават признаци на чревна дисбиоза, която вероятно е свързана с възпаление на червата. Например, намалено изобилие от род Акермансия но увеличено изобилие от Veillonella е открит при деца с хранителна алергия в сравнение със здрави контролни деца.

статия

Все още се наблюдава високо разпространение на атопични заболявания и хранителни алергии на 5-годишна възраст. 12) Възрастта на децата, използвани в останалото проучване на петте споменати по-горе експеримента, е била 2–8 години. 9) По този начин смятаме, че експерименталният му протокол си струва да бъде оценен, но само след коригиране на определени параметри. Например, въпросното проучване използва 27f като грунд, който е известен като неподходящ за усилване Бифидобактерии поради последователни пропуска-мачове. 13) Освен това е известно, че методът за пиросеквениране, използван в изследването, е по-малко точен от широко използвания метод за последователност на Sanger. 14)

В настоящото проучване, за да се оцени възможната връзка на чревната дисбиоза с хранителни алергии, са включени деца на възраст от 18 месеца до 6 години, за които е установено, че са алергични към храни. Чревната им микробиота беше анализирана с помощта на по-малко пристрастни универсални праймери 341F и 805R за 16S рРНК ген и платформа MiSeq като аналитичен метод, който се основава на метода на секвениране на Sanger.

Експерименталният протокол за това проучване е одобрен от комисията по етика на Медицинския университет в Шига (Номер на одобрение: 23-104). Получено е информирано съгласие от родители на всички осем бебета, чиито проби са използвани в това проучване. Четири деца, тежко засегнати от хранителни алергии, които са диагностицирани по клинични симптоми и използващи серумен алерген специфичен IgE тест, са включени в това проучване. Освен това четири здрави деца в подобен възраст като тази на децата с алергия са използвани като контрол. Информацията за всички кърмачета е изброена в таблица 1. Всички деца са били вагинално родени в доносени срокове (> 37 гестационна седмица) и смесени, с изключение на едно контролно дете, което е било кърмено. Не е наложено антибиотично лечение на нито едно от бебетата поне месец преди вземането на пробата.

Публикувано онлайн:

Таблица 1. Клинични данни от осем субекта в това проучване.

Прясно евакуираните изпражнения бяха асептично събрани в стерилизирани контейнери (носене на изпражнения: atect, Осака, Япония) и държани при -20 ° C по време на събирането. След това, в рамките на 24 часа след евакуацията, фекалните проби бяха транспортирани до нашата лаборатория и съхранявани при -80 ° C до по-нататъшна употреба.

16S rRNA секвениране с използване на система MiSeq ™ (Illumina, Сан Диего, Калифорния) се провежда съгласно предварително описан метод. 15) PCR амплификация на 16S рРНК V3-V4 регион беше проведена при използване на праймери 314F и 805R. Обработката на данни за секвениране, включително филтриране на качеството, проверка на химера, дефиниция на OTU и определяне на таксономия, беше извършена с помощта на QIIME, 16) USEARCH, 17) и UCHIME 18) точно както е описано по-горе. 15) Статистическа разлика (стр 19) Честотата на бактериалния род е статистически анализирана чрез хи-квадрат тест на Пиърсън с помощта на софтуер R (версия 3.3.2; https://www.r-project.org/).

При обработката на данните бяха получени общо 205 055 висококачествени последователности (средно: 25 632 четения) и бяха дефинирани 205 OTU (премахнати единични). Анализът на основните компоненти на претегленото разстояние UniFrac показва разлики в чревната микробиота между алергични към храна и здрави деца (PC2: стр Предварително проучване на чревната дисбиоза при деца с хранителна алергия

Публикувано онлайн:

Фиг. 1. График за анализ на основните компоненти на претегленото разстояние UniFrac за чревната микробиота при алергични към храна и здрави деца.

Фиг. 1. График за анализ на основните компоненти на претегленото разстояние UniFrac за чревната микробиота при алергични към храна и здрави деца.

Забележки: Плътните триъгълници показват данни за деца с алергия към храни. Плътните кръгове показват данни за здрави деца.

Публикувано онлайн:

Таблица 2. Състав на чревната микробиота при здрави и хранително алергични деца.

Рядко е изследвана чревна дисбиоза на деца с алергия към храни, особено след отбиване. В настоящото проучване проведохме експеримент за предварителна оценка на чревната дисбиоза при деца с алергия към храна преди по-мащабно проучване. Въпреки че броят на участниците в това проучване беше сравнително малък, то даде интересни данни за характеристиките на чревната микробиота при деца с алергия към храни.

В настоящата работа демонстрирахме, че чревната дисбиоза, която вероятно се свързва с възпаление на червата, се появява при деца с хранителна алергия. Въз основа на нашите резултати, ние предлагаме, като се използват по-големи размери на пробите, си струва да се проведат допълнителни проучвания, фокусирани върху чревната дисбиоза при пациенти с алергия към храната и нейната връзка с възпалението на червата.

Принос на автора

R.I., C.S., T.S. и T.T. са проектирали изследвания, T.S., C.S. и K.N. събрани клинични проби, R.I., M.N. и T.T. извършиха експериментите, R.I. и M.O. анализира данни и R.I., и G.A.R. написа ръкописа. Всички автори са прочели и одобрили окончателния ръкопис.

Декларация за оповестяване

Авторите не съобщават за потенциален конфликт на интереси.

Финансиране

Тази работа беше подкрепена от Фондация за здраве и хранене Morinaga и грант на президента на SUMS за насърчаване на младите изследователи.