• Намерете този автор в Google Scholar
  • Намерете този автор в PubMed
  • Потърсете този автор на този сайт
  • Запис на ORCID за Адам Фрост
  • За кореспонденция: danica.fujimori @ ucsf.edujfraser @ fraserlab.comadam.frost @ ucsf.edu
  • Намерете този автор в Google Scholar
  • Намерете този автор в PubMed
  • Потърсете този автор на този сайт
  • Запис на ORCID за Danica Galonić Fujimori
  • За кореспонденция: danica.fujimori @ ucsf.edujfraser @ fraserlab.comadam.frost @ ucsf.edu

РЕЗЮМЕ

Посттранскрипционните модификации на рибозомната РНК (rRNA) присъстват във всички организми, но техните точни функционални роли и позиции тепърва ще бъдат напълно характеризирани. Модифицираните нуклеотиди са замесени в стабилизирането на структурата на РНК и регулирането на биогенезата на рибозомите и синтеза на протеини. В някои случаи модификациите на рРНК могат да осигурят антибиотична резистентност. Следователно рибозомните структури с висока разделителна способност са необходими за точно определяне на позициите на модифицирани нуклеотиди, задача, която преди това е била изпълнена чрез рентгенова кристалография. Тук представяме структура на крио-електронна микроскопия (крио-ЕМ) на субединицата Escherichia coli (E. coli) 50S със средна разделителна способност 2.2Å като допълнителен подход за картографиране на местата за модификация. Нашата структура потвърждава известни модификации, присъстващи в 23S рРНК и допълнително позволява локализиране на Mg 2+ йони и техните координирани водни молекули. Използвайки нашата крио-ЕМ структура като тестово място, ние разработихме програма за идентификация на пост-транскрипционни модификации на рРНК, използвайки крио-ЕМ карта. Тази програма може лесно да се използва във всяка РНК-съдържаща крио-ЕМ структура, а свързаният с нея плъгин Coot позволява визуализация на валидирани модификации, което го прави изключително достъпен.

разделителна