Годишен преглед на науката и технологиите за храните

превод

Кн. 8: 113-134 (Дата на публикуване на том, февруари 2017 г.)
Публикувано за първи път онлайн като Преглед предварително, на 11 януари 2017 г.
https://doi.org/10.1146/annurev-food-030216-025729

Aaron M. Walsh, 1,2,3 Fiona Crispie, 1 Marcus J. Claesson, 2,3 и Paul D. Cotter 1,2

1 Център за изследване на храните Teagasc, Moorepark, Fermoy, Корк, Ирландия; имейл: [имейл защитен]

2 APC Microbiome Institute, University College Cork, Корк, Ирландия

3 Училище по микробиология, Университетски колеж Корк, Корк, Ирландия

Резюме

Този преглед изследва приложенията на технологиите omics в микробиологията на храните, с основен фокус върху технологиите за високопроизводително секвениране (HTS). Ние обсъждаме различните подходи за секвениране, приложими за изследването на свързани с храната микробни изолати и смесени микробни съобщества в храните, и предоставяме преглед на платформите за секвениране, подходящи за всеки подход. Ние подчертаваме потенциала на геномиката, метагеномиката и метатранскриптомиката, за да насочим усилията за оптимизиране на ферментациите на храни. Освен това изследваме използването на сравнителна и функционална геномика за по-нататъшно разбиране на механизмите на пробиотично действие и описваме приложимостта на HTS като мярка за безопасност на храните. И накрая, обмисляме използването на HTS за изследване на ефектите, които погълнатите микроби имат върху човешката чревна микробиота.