Представен е обобщаващ подход за мета-анализ на набори от данни за микробиоми

Диетите с високо съдържание на мазнини предизвикват възпроизводими промени в микробиома на червата на мишката

Нежизнеспособното замърсяване с лактококи е широко разпространено в експерименталните диети

Филогенетичните и генните подписи се превеждат в човешки микробиоми

Обобщение

Множество изследователски групи показват, че диетата влияе върху чревния микробиом; обаче, вариабилността в експерименталния дизайн и количествената оценка правят предизвикателството да се оцени степента, до която подобни диети имат възпроизводими ефекти в рамките на проучванията. Чрез обективна рамка за метаанализ на субект, ние анализирахме отново 27 диетични проучвания, включително 1101 проби от гризачи и хора. Ние демонстрираме, че диетата с високо съдържание на мазнини (HFD) възпроизводимо променя структурата на чревната микробна общност. По-финият таксономичен анализ разкри, че най-възпроизводимите сигнали на HFD са видове Lactococcus, които експериментално демонстрираме като често срещани диетични замърсители. Освен това подходът за машинно обучение дефинира подпис, който предсказва приема на диети с мишки и демонстрира, че филогенетичните и генно-ориентирани трансформации на този модел могат да бъдат преведени на хората. Заедно тези резултати демонстрират полезността на микробиомните мета-анализи при идентифициране на стабилни и възпроизводими характеристики за механистични изследвания в предклинични модели.

Графичен резюме

разкрива
  1. Изтегляне: Изтегляне на изображение с висока разделителна способност (237KB)
  2. Изтегляне: Изтеглете изображение в пълен размер

Предишен статия в бр Следващия статия в бр