Акценти

RVC щамове са открити в 46% от свински фекални или чревни проби.

филогенетичен

Идентифицирахме свински RVC в 34% от отрицателните проби на RVA и RVB.

При прасета ≤ 3 дни, 78% от RVC положителните проби са отрицателни за RVA и RVB.

Откриване на RVC в свински белодробни тъкани чрез RT-PCR.

Ревизираната класификация на RVC VP7, използвайки 85% отсечка от нуклеотиди, дава 9 G генотипове.

Резюме

Ротавирусът С (RVC) е основна причина за гастроентерит при свинете. Между декември 2009 г. и октомври 2011 г. са анализирани 7520 проби от свине от стада в САЩ и Канада. RVC РНК е открита в 46% от тестваните проби. При много млади прасета (≤3 дни) и млади прасенца (на възраст 4–20 дни), съответно 78% и 65%, RVC положителните проби са отрицателни за RVA и RVB. RVC РНК също е открита в 10% от тестваните белодробни тъкани. Освен това изследвахме молекулярното разнообразие на свински RVC чрез секвениране на VP7 генния сегмент от 65 екземпляра, давайки 70 VP7 генни последователности. Въз основа на двойни профили на честота на идентичност и филогенетични анализи беше изчислена гранична стойност на класификацията на нуклеотидни 85%, използвайки новите данни за последователността, генерирани в това проучване (n = 70) и предварително публикувани RVC VP7 последователности (n = 82), което доведе до идентифицирането на 9 VP7 RVC генотипа, G1 до G9.

Предишен статия в бр Следващия статия в бр